Cada unidade da federação pode inscrever de dez a onze atletas por gênero.
Os jogos serão divididos em dois tempos de 25 minutos com intervalo de dez minutos. As equipes serão distribuídas em três divisões, considerando a classificação final da última edição Jogos da Juventude.
A competição de handebol será realizada de acordo com as regras oficiais da International Handball Federation (IHF), adotadas pela Confederação Brasileira de Handebol (CBHb), salvo o estabelecido nos regulamentos dos Jogos da Juventude.